Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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