Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
BMI1P35226 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms