Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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