Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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HOXA13P31271 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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