Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC5P28715 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms