Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRGP23470 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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