Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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