Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDSP20132 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDSP20132 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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