Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms