Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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