Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHOP08100 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHOP08100 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHOP08100 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms