Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM38O00635 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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