Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
USP17L23D6RBM5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms