Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.4 ms