Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms