Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms