Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms