Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms