Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms