Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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