Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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