Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms