Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms