Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C18orf8Q96DM3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms