Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTSSAQ969W0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTSSAQ969W0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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