Protein–RNA interactions for Protein: Q92538

GBF1, Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBF1Q92538 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBF1Q92538 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBF1Q92538 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms