Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms