Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM48Q8IWZ4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM48Q8IWZ4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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