Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL17Q6UXB2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms