Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AGAP9Q5VTM2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms