Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms