Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL40Q2TBA0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms