Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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COL24A1Q17RW2 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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COL24A1Q17RW2 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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