Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms