Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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