Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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CDSNQ15517 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CDSNQ15517 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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