Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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