Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms