Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms