Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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STRN3Q13033 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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