Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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