Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TROQ12816 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TROQ12816 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TROQ12816 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TROQ12816 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TROQ12816 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms