Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FOXO1Q12778 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXO1Q12778 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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