Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms