Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms