Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms