Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms