Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC7A5Q01650 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms