Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms