Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ACTBP60709 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ACTBP60709 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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